自動清洗紫外線消毒器在水處理領域有廣泛的用途。水處理從使用紫外線殺菌燈的方法來分，有直接把燈放入水中，稱為浸沒式；紫外線燈放入紫外線消毒器腔體中的套管里使用，稱為過流式紫外線消毒器。

 

　　自動清洗紫外線消毒器與過流式相比，結構更簡單。紫外線殺菌燈直接放在水中，這種方法可用于流動的動態水，也可用于靜態水。這種處理方法要注意燈管有可能由于意外情況發生破裂；長時間處理，燈管表面會被水中藻類等污染物覆蓋，將嚴重影響紫外線透出。

 

　　自動清洗紫外線消毒器在水處理主要應用它的殺菌功能，比如過流式紫外線消毒器設備工作原理是這樣的：經水泵產生壓力的一定流速的水流流過紫外線消毒器腔體內壁和能透紫外的石英套管外圍，紫外線燈產生的254nm紫外線對水進行消毒、殺菌。其特點是水流流速很快，一般在石英外套流過的時間為不超過1秒，因此要求殺菌燈的紫外線強度是很高的，一般要求在表面強度超過30000uw/cm2。要產生如此高的紫外線強度，需選用高強度大功率的紫外線殺菌燈。如果仍然想通過延長時間來提高消毒效果，那么一般選用較長的燈，做較長的設備，或在外壁上處理成渦流旋轉式結構，來延長水流過的時間。

 

　　汞齊燈，即汞齊紫外線殺菌燈。紫外線殺菌燈的一種，大多數為水處理殺菌燈，由于汞齊燈的高功率和長壽命，能耗和維修周期都大大縮短，成為一種可替代打壓和中壓汞燈的經濟的選擇。它們能節約能量，并僅產生極少熱量，紫外輸出功率是一般低壓汞燈的3-10倍，能夠適用的環境溫度可高達90°C。